El sorteo se realizó la mañana de este 25 de marzo de 2022, en Paraguay. Los clubes nacionales fueron ubicados en distintos bolilleros y ya conocen a sus rivales para la nueva etapa del torneo.
Cuatro equipos ecuatorianos ya cuentan con los conjuntos rivales que enfrentarán en la segunda fase de la Copa Sudamericana: Liga de Quito, Universidad Católica, Barcelona y 9 de Octubre.
Liga de Quito fue el único cabeza de serie en el sorteo, así quedaron definidas las llaves de los tricolores:
Grupo A
Lanús
Wanderers
Metropolitanos
Barcelona
Grupo C
Santos
Unión La Calera
Banfield
U. Católica
Grupo E
Internacional
Ind. de Medellín
9 de Octubre
Guareña
Grupo F
Liga de Quito
Defensa y Justicia
Atlético Goianiense
Antofagasta